崇左市扩大基本医疗保障覆盖面，全面推进新型农村合作医疗制度建设。全市近１８０万农民参加农村合作医疗，参合率达到９３％。该市的主要做法是：

    加强宣传，全市除了用广播、电视、报纸等新闻媒体向广大农村农民宣传新型农村合作医疗制度的意义和好处外，还利用宣传报、讲座，健康咨询形式进行广泛宣传。据统计，到目前为止，该市已出版慢性病防治宣传简报１８期，开办健康讲座１５次，发放健康教育处分５０００份，接受健康咨询２３８０次；开张义诊活动１５次，接受监测血压达８６６２人次。同时，该市在推行新农合过程中，还注意进行病案管理，其中为血压专案规范管理４６１人，糖尿病档案管理４６人，其他慢病管理６４人。

    提高基本医疗保障水平。全面落实政府对新农合人均每年８０元补助任务。新农合筹资比例为：中央补助４０元，自治区政府补助２３元，市级政府补助５．１元，县级政府补助１１．９元，农民自筹２０元。“新农合基金能够给参合农民最大补偿额度；一年内住院补偿基金封顶线为１００００元；一年内累计重大疾病补偿金超过１０００元的由县级新农合领导小组讨论补助比例”，目前崇左市各县（市、区）普遍实行的大病补助每人最高可达３万元，达到了农民人均纯收入的６倍左右。乡镇卫生院住院按８０％比例补偿；县级医疗卫生机构住院按５０％比例补偿；县级以上医疗卫生机构住院按４０％比例补偿。

    该市在江州区、凭祥市区建立城镇居民和农村居民健康档案。其中：建立居民健康档案２００９９人份，家庭档案８３２７户，常住人口建档１１４７９人份，建档率达１９％。